A través de la publicación del nuevo reporte de vigilancia de variantes de SARS-CoV-2 en CABA, las provincias de Buenos Aires, Córdoba, Entre Ríos, Mendoza, Neuquén, Río Negro, San Luis y Santa Fe, el Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2 confirmó que en Tandil circulan las cepas de Gran Bretaña y Manaos, tal como habían anunciado las autoridades del Sistema Integrado de Salud Pública de Tandil.

De acuerdo a lo informado en el nuevo boletín del Proyecto Argentino Interinstitucional de Genómica de Sars-CoV-2 (PAIS), cinco muestras de Tandil dieron positivo a la variante 501Y.V1 (Reino Unido) y una a la 501Y.V3 (Manaos).

En el reporte número 20, publicado el pasado viernes 7 de mayo, se expusieron los casos analizados y confirmados en el período comprendido entre el primero de marzo y el 24 de abril. Según explicaron, lo que se hizo fue una secuenciación parcial del gen que codifica para la proteína Spike en muestras de las diferentes provincias mencionadas.

En lo que atañe específicamente a la provincia de Buenos Aires, indicaron que se analizaron 296 muestras de individuos sin antecedente de viaje al exterior o contacto estrecho con viajeros (81 del interior bonaerense).

De todas ellas, 72 dieron positivo para la cepa de Reino Unido y, de ese total, 13 corresponden al interior. Lo alarmante es que casi la mitad de los casos corresponden a nuestra ciudad: de ocho muestras enviadas de personas sin antecedente de viaje al exterior ni nexo epidemiológico con viajeros, cinco dieron positivo, lo cual refiere un 62,5 por ciento de positividad y marca que esa variante circula de manera comunitaria en Tandil.

El resto de los casos corresponden a Mercedes (tres), Suipacha, Bahía Blanca, América, San Nicolás y Mar del Plata.

En tanto, el porcentaje de positividad desciende drásticamente cuando se trata de la cepa de Manaos ya que de la misma cantidad de muestras enviadas solo una dio positiva (12,5 por ciento), aunque de todas formas, al no haber viajado el paciente ni tampoco haber estado en contacto estrecho con alguien que sí lo hiciera, marca que también circula esa variante en la ciudad.

Cabe destacar que esta es la cepa que más se halló en la provincia de Buenos Aires, con un total de 181 casos. La gran mayoría de ellos se registraron en la Ciudad Autónoma de Buenos Aires y Gran Buenos Aires, mientras que sólo 18 en el interior: dos en Mercedes; dos en Suipacha; uno en San Antonio de Areco; 12 en Mar del Plata; y el restante en Tandil.

Por otra parte, confirmaron que además de las variantes de Manaos y de Reino Unido también circula en Tandil la mutación S_L452Q del virus (Andina), la cual se observó en un total de 196 muestras analizadas.

Destacaron desde el Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2 que en ninguna de las 602 secuencias analizadas en el reporte se observó la combinación de mutaciones característica de la variante 501Y.V2 (Sudáfrica).

Las conclusiones del estudio

La vigilancia activa de las variantes de coronavirus realizada sobre un total de 1.848 muestras obtenidas entre octubre de 2020 y abril de 2021 permitió determinar la presencia de cuatro variantes de interés epidemiológico mundial en nuestro país: Reino Unido, Manaos, Río de Janeiro y California.

Es pertinente señalar que, por el momento, en esta ciudad sólo se ha detectado la circulación de las cepas de Reino Unido (cinco casos) y Manaos (un caso).

En ese sentido, detallaron en el informe que se observó un aumento en la frecuencia de detección de estas dos variantes en casos sin nexo epidemiológico con turismo al exterior durante las últimas semanas epidemiológicas.

Entre los casos particulares que destacaron, advirtieron que Tandil presentó un 62,5 por ciento de los casos asociados con variante 501Y.V1 (Reino Unido) y sólo un 12,5 por ciento con la 501Y.V3 (Manaos).

En lo que atañe a las muestras seleccionadas para el estudio, explicaron que en el caso de las de Tandil, sobre un total de 489 hisopados nasofaríngeos analizados entre el 11 y el 18 de abril en el Laboratorio de Virología de la Facultad de Ciencias Veterinarias de la Unicen con sospechas de Covid-19, 69 dieron resultados positivos y, de ellas, se seleccionaron diez al azar para ser enviadas al nodo central del Proyecto PAIS.

Para finalizar, el Consorcio Argentino Interinstitucional de Genómica de SARS-CoV-2 informó que continuará realizando la vigilancia molecular sobre los casos de circulación comunitaria, a fin de monitorear con rapidez la presencia de variantes de interés epidemiológico internacional y la emergencia de variantes virales locales. A la par, se seguirán caracterizando los genomas completos de SARS-CoV-2 que han circulado desde el inicio de la epidemia en diferentes regiones del país.

Proyecto PAIS

El Proyecto Argentino Interinstitucional de Genómica de SARS-CoV-2 es desarrollado por el Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2 y financiado, a través del subsidio FONARSEC IP COVID-19 N° 247, por la Agencia Nacional de la Promoción de la Investigación, el Desarrollo Tecnológico y la Innovación del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación, Argentina.

El objetivo es analizar la trayectoria evolutiva de las cepas del Covid-19 que circulan en Argentina para estudiar su origen y dispersión en el país, en el contexto de las cepas mundiales, como así también analizar las mutaciones que pudieran afectar el diagnóstico, la transmisión y la virulencia del virus.

A través de la publicación del nuevo reporte de vigilancia de variantes de SARS-CoV-2 en CABA, provincias de Buenos Aires, Córdoba, Entre Ríos, Mendoza, Neuquén, Río Negro, San Luis y Santa Fe, el Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2 confirmó que en Tandil circulan las cepas de Gran Bretaña y Manaos, tal como habían anunciado las autoridades del Sistema Integrado de Salud Pública de Tandil.

De acuerdo a lo informado en el nuevo boletín del Proyecto Argentino Interinstitucional de Genómica de Sars-CoV-2 (PAIS), cinco muestras de Tandil dieron positivo a la variante 501Y.V1 (Reino Unido) y una a la 501Y.V3 (Manaos).

En el reporte número 20, publicado el pasado viernes 7 de mayo, se expusieron los casos analizados y confirmados en el período comprendido entre el primero de marzo y el 24 de abril. Según explicaron, lo que se hizo fue una secuenciación parcial del gen que codifica para la proteína Spike en muestras de las diferentes provincias mencionadas.

En lo que atañe específicamente a la provincia de Buenos Aires, indicaron que se analizaron 296 muestras de individuos sin antecedente de viaje al exterior o contacto estrecho con viajeros (81 del interior de la PBA).

De todas ellas, 72 dieron positivo para la cepa de Reino Unido y, de ese total, 13 corresponden al interior. Lo alarmante es que casi la mitad de los casos corresponden a nuestra ciudad: de ocho muestras enviadas de personas sin antecedente de viaje al exterior ni nexo epidemiológico con viajeros, cinco dieron positivo, lo cual refiere un 62.5 por ciento de positividad y marca que esa variante circula de manera comunitaria en Tandil.

El resto de los casos corresponden a Mercedes (tres), Suipacha, Bahía Blanca, América, San Nicolás y Mar del Plata.

En tanto, el porcentaje de positividad desciende drásticamente cuando se trata de la cepa de Manaos ya que de la misma cantidad de muestras enviadas solo una dio positivo (12.5%), aunque de todas formas, al no haber viajado el paciente ni tampoco haber estado en contacto estrecho con alguien que sí lo hiciera, marca que también circula esa variante en la ciudad.

Cabe destacar que esta es la cepa que más se halló en la provincia de Buenos Aires, con un total de 181 casos. La gran mayoría de ellos se registraron en la Ciudad Autónoma de Buenos Aires y Gran Buenos Aires, mientras que solo 18 en el interior: dos en Mercedes; dos en Suipacha; uno en San Antonio de Areco; 12 en Mar del Plata; y el restante en Tandil.

Por otra parte, confirmaron que además de las variantes de Manaos y de Reino Unido también circula en Tandil la mutación S_L452Q del virus, la cual se observó en un total de 196 muestras analizadas.

Destacaron desde el Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2 que en ninguna de las 602 secuencias analizadas en el reporte se observó la combinación de mutaciones característica de la variante 501Y.V2 (Sudáfrica).

Si bien desde que se comenzó con la campaña de vacunación se destacó que las dosis no impedirían el contagio de Covid-19 sino que evitarían que el virus ocasionara cuadros graves, lo cierto es que algunas personas que habían sido inoculadas igualmente debieron ser internadas en los centros de salud por algunas complicaciones.

En Tandil fueron tres los casos de pacientes que habían recibido la vacuna y que tuvieron que ser trasladados al Hospital. En todos ellos, lo que se hizo fue la genotipificación para conocer cuál era la cepa del virus que los estaba afectando, y así fue como se descubrió que en nuestra ciudad circulaban la de Manaos y la británica.

“Y también tenemos personal de salud que está vacunado con dos dosis, en su mayoría desde el inicio de la campaña porque fueron los primeros en recibirla, que se ha contagiado. Por lo menos tenemos 14 al día de hoy que se han infectado a pesar de tener la vacunación completa”, refirió el vicepresidente del Sistema Integrado de Salud Pública, Matías Tringler, y completó: “Se puede decir que ninguno estuvo grave, pero sí que tuvieron infección”.

Mientras que durante el 2020 la gran mayoría de los ciudadanos que requirieron internación fueron mayores de 70 años, el impacto de la segunda ola de Covid-19 hizo que cada vez fueran más los menores que tuvieran que acudir a un centro asistencial.

Al respecto, Matías Tringler, vicepresidente del Sistema Integrado de Salud Pública, reveló que el 40 por ciento de los internados hoy en día en las tres instituciones de la ciudad son menores de 50 años y, de todos ellos, varios estaban sanos y no presentaban comorbilidades, “cosas que no vimos el año pasado”.

Por ello, resaltó que la situación es muy alarmante y muy crítica, y expuso que necesitan que toda la ciudadanía respete los protocolos vigentes y continúe cuidándose.

En tanto, si bien refirió que no han tenido casos graves en adolescentes, como sí sucedió en la Ciudad Autónoma de Buenos Aires, sí hubo un hecho en particular de un joven que estuvo internado en el Hospital de Niños Dr Debilio Blanco Villegas pero que tenía algunas patologías previas.

“Esperemos que siga todo así, que todavía no hemos tenido casos graves. Igualmente sí hubo jóvenes de 25, 30 y 35 años que debieron ser asistidos por neumonías fuertes”, señaló el vicepresidente del SISP.

Asimismo, enfatizó que mientras que en el 2020 muchos de los internados presentaban algunas patologías previas, ahora hay mucha gente sana que requiere pasar a terapia intensiva: “La chica que debió ser derivada a Pinamar, otra de 42 años que requirió terapia y una de 35 que está muy grave internada. Es gente que a priori no tiene factores de riesgo importantes como veníamos viendo el año pasado. Y esto se atribuye, aparentemente, a las nuevas cepas que son más agresivas en los pacientes jóvenes”.

El vicepresidente del Sistema Integrado de Salud Pública, Matías Tringler, en diálogo con Eco Noticias confirmó que hay circulación comunitaria de las nuevas cepas de Covid-19, conocidas como variantes Manaos y británica, algo que se preveía desde el Municipio

La particularidad de estas mutaciones virales es que son más transmisibles y virulentas que la original, por eso la aceleración en la curva de contagios. De las muestras remitidas para su análisis al Instituto Nacional de Epidemiología “Dr. Juan H. Jara”, en cinco de ellas se detectó la cepa del Reino Unido y en una  la proveniente de Brasil.

Según informó Tringler, las muestras evaluadas corresponden a pacientes internados y personal de salud, sin antecedentes de viaje, lo que evidencia que estas variantes ya circulan de manera comunitaria.

“Estas cepas están en estudio y se sabe que además de ser más contagiosas, tienen cierta resistencia a las vacunas y se está evaluando esto. La gente vacunada se puede contagiar igual, pero tiene mayor protección y más chances de hacer un cuadro menos agresivo”, detalló.

Además, indicó que se registró un “amesetamiento” en el crecimiento semanal de casos y que esta semana será crucial para saber cómo se está comportando el virus. Al respecto, explicó que la semana finalizó con 723 nuevos casos, un 14 por ciento más que el periodo anterior, y aclaró que “veníamos con un crecimiento del 18 por ciento, esto quiere decir que ha disminuido la velocidad de infección, la cifra crece pero va más lento”.  

En tanto, recordó que hace un mes se detectó un incremento del 100 por ciento y los números en las semanas posteriores rondaban el 70 por ciento, por este motivo el funcionario consideró que hablar ahora de porcentuales de 18 y 14 significa “que se han desacelerado los contagios”.

“Quizás tiene que ver con las medidas de restricción, con que hay mayor conciencia en la gente. Esta semana es clave para ver si después los casos empiezan a bajar”, sostuvo.  

Cuando emergió el plan internacional de vacunación, nuevas variantes de coronavirus hicieron saber que las cosas iban a complicarse. La cepa de SARS-CoV-2 del Reino Unido (B.1.1.7) se identificó por primera vez en un virus aislado a partir de un paciente el 20 de septiembre de 2020, pero en un primer momento no generó ninguna sospecha. A mitad de noviembre ya estaba presente en el 26 por ciento de los casos. En la semana del 9 de diciembre, en el 60 por ciento de las muestras secuenciadas de pacientes en Londres. Hoy es dominante en el país y está presente en más del 70 por ciento.

A finales de 2020, la Red de Vigilancia Genómica de Sudáfrica identificó la variante 501Y.V2, que puede propagarse mejor entre las personas en comparación con otras, y además podría ser capaz de evadir parcialmente los anticuerpos generados por una infección anterior o la vacuna. Hoy está presente en más de 40 países.

En enero de 2021 se identificó por primera vez la variante P.1 en viajeros provenientes de Brasil que llegaron a Japón. Esta tiene mutaciones que, al igual que lo que ocurre con la identificada en Sudáfrica, podrían afectar a la capacidad de los anticuerpos generados, ya sea por la infección natural o por la vacunación, de reconocer y neutralizar el virus. Estos datos son preocupantes y hacen sospechar que estas variantes pueden tener un efecto importante en la forma en la que infecta el virus, ya sea aumentando su transmisión, infectividad o esquivando al sistema inmune. Sin embargo, ¿por qué solo se habla de sospechas y no se dice claramente si estas variantes son peligrosas o no? ¿Por qué tardan tanto en decir algo que parece tan evidente?

La respuesta es que no se dice porque realmente no se sabe con certeza. “Es cierto que la ciencia no va siempre tan rápido como nos gustaría –dice José M. Jiménez Guardeño, investigador en el Departamento de Enfermedades Infecciosas del King’s College London en un informe que analiza este tema–, pero es importante tener en cuenta que el hecho de que algo pueda parecer evidente no significa que sea cierto. Antes de afirmar algo, hay que comprobarlo”.

Datos

Hasta ahora lo único que existe son datos epidemiológicos donde se compara el crecimiento en el número de casos infectados con cada variante dentro de una misma población. De ahí vienen los titulares que dicen que “la variante de Reino Unido podría ser hasta 70 por ciento más contagiosa”. “Sin embargo –continúa el especialista–, aunque con estos datos podemos sospechar muy claramente que algunas de estas variantes podrían transmitirse mejor, no se puede concluir nada porque son sólo estimaciones. Estos porcentajes podrían deberse a otras razones. Por ejemplo, a eventos de superpropagación o a que esas variantes simplemente crecen un poquito mejor que las anteriores y por eso se han impuesto de forma tan clara”.

Un ejemplo de evento de superpropagación podría ser un individuo infectado con una nueva variante que va a una fiesta o un concierto donde no usa medidas de prevención, o simplemente tiene una gran vida social y hace caso omiso de las recomendaciones. Por otro lado, un ejemplo de mutación que otorga cierta ventaja al virus pero no necesariamente hace que se transmita mejor se puede ejemplificar con la mutación D614G. Apareció en Europa en febrero de 2020 y acabó imponiéndose en el resto del mundo en unos meses. Hasta ahora, hay ciertas evidencias en laboratorio de que los virus con esta mutación podrían transmitirse mejor, pero no está del todo claro.

¿Cómo se explica entonces que haya tantos casos? Puede ocurrir que un virus crezca mejor que otros en células, y por eso se impone su secuencia. Sin embargo, esto no siempre significa que tenga que aumentar su transmisión. Por lo tanto, aunque todo indique que estas variantes puedan ser más transmisibles que las anteriores, para poder concluir realmente algo hay que hacer experimentos controlados en el laboratorio. Esto requiere de tiempo y solventar ciertos problemas que van apareciendo.

Tubos de ensayo

Lo primero es ver cómo crecen las nuevas variantes en cultivos celulares en comparación con las anteriores. Sin embargo, esto presenta un gran problema porque el virus, además de mutar cuando infecta a las personas, también lo hace en el laboratorio. A ellos llegan en un tubito. Para poder estudiarlos, primero hay que hacer crecer el virus en células hasta tener cantidad suficiente para hacer experimentos. El problema es que cuando se multiplican suelen adquirir mutaciones en ciertas regiones de su genoma. Por lo general, la parte del virus que muta más al replicarse en laboratorio es la proteína S (la llave que utiliza el virus para entrar en la célula) que también es la zona donde la mayoría de las nuevas variantes ha incorporado las mutaciones más interesantes.

Por lo tanto, no es tan fácil. Primero hay que cultivarlo en cantidades suficientes y asegurarse, en cada paso, de que mantiene las mutaciones originales y que, además, no ha incorporado otras nuevas. Lo siguiente es hacer experimentos para estudiar su transmisión en comparación con otras variantes. Para ello se usan modelos animales, como por ejemplo hurones. En estos experimentos se infectan los animales y se colocan en celdas con otros sin infectar para ver si hay transmisión directa o no. Además, se colocan animales en otras celdas para evaluar la transmisión indirecta.

También, hay que tener en cuenta que el efecto de las distintas mutaciones puede ir mucho más allá de aumentar la transmisibilidad del virus o su letalidad. Por ejemplo, una prepublicación reciente y muy preliminar (pendiente de revisión por pares) sugiere que la infección por la variante identificada en Reino Unido podría durar más tiempo en comparación con las variantes anteriores y, así, eludir las cuarentenas. Según esta hipótesis, que requerirá de más estudios que la corroboren o descarten, una solución podría ser alargar estos períodos.

“Es importante remarcar que –concluye el especialista–, aunque no haya evidencias concluyentes de que estas nuevas variantes sean más transmisibles o letales que las anteriores, está claro que algo hacen. Representan un problema real que hay que afrontar. Por lo tanto, en casos como estos, donde la sospecha de una mayor transmisión es bastante alta, es importante tomar decisiones aunque sea de manera preventiva y reforzar las medidas para evitar males mayores”.